合同中仲裁条款独立有效性原则是指合同中的仲裁条款具有相对的独立性，其有效性不受合同有效性的影响。即使合同无效或合同终止，仲裁条款仍然有效。仲裁条款独立有效性学说的理论根据是：
（1）合同规定当事人双方实体方面的权利义务，仲裁条款规定当事人实体方面的权利义务得不到实现时的法律救济措施。合同得到全部履行，仲裁条款无须履行，合同未履行，则需履行仲裁条款，二者彼此独立。
（2）仲裁条款有独立于合同的效力。合同的有效性取决于合同形式要件和合同实质要件是否符合合同准据法的规定，仲裁条款的有效性取决于仲裁机构所在地国家法律或仲裁规则对仲裁条款形式、内容的规定。判断二者有效性的法律根据不同。
（3）仲裁条款独立于合同中的其他条款。合同中的任何其他条款均可与仲裁条款分开，合同中的其他条款是否有效，不影响仲裁条款对当事人的拘束力。