对淋巴细胞表面抗原进行连续检测可明确淋巴细胞分化过程中各阶段表面抗原的表达，并检出异常表型的淋巴细胞，它们往往是恶性肿瘤细胞，如恶性淋巴瘤的典型特征是单一表型的单克隆淋巴细胞群。利用单克隆抗体也可对白血病细胞进行免疫分型，并对异向性治疗和预后判断提供帮助，FCM可同时测定细胞膜抗原、胞质抗原和DNA含量，有助于血液系统恶性疾病的检测、治疗和预后分析。白血病的准确分类是选择化疗方案和判断预后的主要依据，FCM结合单抗的应用可提高白血病分类诊断符合率，并分期；可对慢性粒细胞性白血病急性发作时的主要病变细胞进行分析，对白血病复发的主要根源-微小残留病变的检出有高特异性和敏感性，故在缓解期患者检测微小残留病变以避免复发。