锅炉负荷变动时，给水流量、循环倍率以及分离器出口的蒸汽湿度均会发生变化。例如当负荷降低时，给水流量减少，但水冷壁管中工质流量减少不多，因而循环倍率增大，进入分离器的工质湿度也增大，但这时进入过热器的蒸汽湿度反而减少。这是因为锅炉负荷降低时，分离器的蒸汽负荷和工作压力相应降低，有利于汽水分离。全负荷复合循环锅炉分离器出口的蒸汽湿度这种变化，也使其汽温特性与其他型式锅炉不同。在低负荷时进入过热器的蒸汽带水少，对过热器的喷水量就要增加，在某一负荷下，喷水量达到最大值，低于这个负荷时，由于过热器的对流特性起主要作用，喷水量将随负荷的降低而减少。
在运行中，分离器水位波动较大。尽管分离器高度很大，允许水位有较大幅度的波动，但也不能低于规定的最低水位。