网上证券交易的模式选择，必须考虑相互关联的两个问题：一是网上证券交易经纪商的资格认证问题二是采取自由定价的竞争模式还是固定佣金的竞争模式，也即是用固定佣金制度，还是允许竞争实行自由佣金制度，允许折扣经纪商的存在。
（1）国外网上证券交易
在国外网上证券交易经营方式主要有四种：传统的经纪商兼营网上经纪业务折扣经纪商提供网上经纪业务纯粹的网上经纪商传统的经纪商设立一个独立的网上经纪子公司。
（2）我国网上证券交易的两种经营模式
目前我国网上证券交易采取两种经营方式：
第一，营业部直接与互联网联接起来，客户通过营业部的网站直接进行证券交易活动，采用这种方式的营业部投资很高。
第二，营业部通过网络服务商和互联网联系起来，网上客户的下单请求通过ISP的网站送达营业部，并从ISP网站上实时获取股市行情和成交结果（客户→ISP网站→营业部→证券交易所）。