一、宇宙生成论
“无极而太极。太极动而生阳，动极而静，静而生阴，静极复动。一动一静，互为其根；分阴分阳，两仪立焉。阳变阴合而生水火木金土，五气顺布，四时行焉。五行一阴阳也，阴阳一太极也，太极本无极也。”
周敦颐认为有形有象的二气五行和万物，都统一于“太极”，而“太极”亦即无象无形的“无极”。“太极”是宇宙万物最根本的实体，“无极”是指“太极”是无形无象的。周敦颐称阴阳是二气，称五行是五气，又说“太极”一动一静产生了阴阳二气，所谓“太极”就是阴阳二气的统一体。周敦颐又称，“太极”动静而生阴阳，“太极”的动静，无形无状，微妙不测，称之为“神”，“神”是万物变化运动的内在根源。
二、人性和道德学说
在人性和道德问题上，周敦颐认为有一种超然的本性，叫做“诚”。
（1）“诚”是人的根本特性
周敦颐发挥了《中庸》的观点：即《中庸》“诚者，天之道也。诚之者，人之道也。”周敦颐认为：“诚者圣人之本。纯粹至善者也。”“诚，五常之本，百行之源也。”
即，“诚”是从阳气得来的，是绝对至善的，是一切道德的根源。人如果能体现“诚”的本性，其行为就符合仁、义、礼、智、信的道德标准，仁、义、礼、智、信只是城的表现而已。
（2）“主静”的修养方法
周敦颐继承了古代儒家“中庸”、道家“清净”，佛家“寂静”的思想，提出“主静”学说，作为修养方法。他提出“唯人也得其秀而最灵。形即生矣，神发知矣，五性感动而善恶分，万事出矣。圣人定之以中正仁义（自注：圣人之道，仁义中正而已矣），而主静（自注：无欲故静），立人极焉。”（五性：善、恶、刚、柔、中）
所谓“静”就是安定、安宁。所谓“无欲”，就是没有私欲的干扰。他认为，人能“无欲”，仁义道德的“本性”也就充分发挥出来了，这就是他所说的“诚”的境界。