所谓根本政治制度意味着：
第一，人民代表大会制度直接反映了中国的国家性质。宪法规定“中华人民共和国是工人阶级领导的、以工农联盟为基础的人民民主专政的社会主义国家。”国家的一切权力，包括运用和行使国家政权的权力属于人民。人民代表大会是人民行使国家政权的组织形式。
第二，人民代表大会制度在整个国家的政治制度体系中具有“根本性”的权力渊源地位，其他的国家制度、国家机构，其权力、合法性均来自于人民代表大会制度，在宪法和法律上，人民代表大会与其他制度和机构相比，是本源性的、根本性的。
第三，人民代表大会是“人民”行使统治和管理国家政权权力的、具有相对低成本和较高可接近性的机构。相比较而言，在现有的国家政治制度中，人民代表大会与“人民”的距离最近、“人民”最容易进入和产生影响，人民代表大会最具有直接代表和反映“人民”意愿和要求的能力。
第四，人民代表大会制度的丰富内涵也决定了它具有一种“根本性”。所谓人民代表大会制度，就是以人民代表大会为基石构建的国家政权体系，它主要规定了人民代表大会同产生它的人民的关系，规定了人民代表大会同它产生的‘一府两院’等其他国家机关的关系，规定了中国共产党同人民代表大会及其他国家机关的关系。选举制度是人民代表大会制度的基础。民主集中制是人民代表大会制度的组织原则。这三个‘关系’、一个‘基础’、一个‘原则’，概括地反映了我国政治生活的全貌，集中地体现了国家的性质。一句话，人民代表大会制度是实现党的领导和人民当家作主的有效的政权组织形式。”
第五，人民代表大会的“根本性”还在于它与西方议会民主制具有根本的区别。中国实行中国共产党领导下的多党合作制度，西方国家实行多党竞争制度。一党领导的多党合作制度与多党地位平等的多党竞争制度需要不同的政党生存和竞争的制度空间。与中国共产党领导下的多党合作制度相适应的政党活动空间是人民代表大会，而与西方多党竞争相适应的政党活动空间是议会民主制。在目前阶段，在中国实行有中国特色的社会主义政治制度具有根本的重要政治意义，因此具有中国特色的政治制度所必然要求的政党活动空间的模式——人民代表大会制度也就具有了根本性的地位和意义。