1、地位作用：学校行政组织在学校全部活动中处于主体地位，发挥主导作用，领导和管理工作学校全部行政和业务工作，对学校的办学方向和教育质量起决定作用。学校的非行政组织，以中共党的基层组织为核心对学校的群众组织对学校的行政工作分别起咨询参谋作用，支持配合作用和桥梁纽带作用，学校的业务组织是在行政组织的领导管理下，直接或间接参与学校教育教学活动。
2、相互关系：第一，以学校统一的共同目标联系在一起，各机构都要为目标努力；第二，工作上必须以教学为中心；第三，在组织上都必须是学校系统有机组成部分