同一控制下的企业合并中，合并方为企业合并发生的审计法律服务评估咨询等中介费用以及其他相关管理费用，应当于发生时计入当期损益；非同一控制下的企业合并中，购买方为企业合并发生的审计法律服务评估咨询等中介费用，应当于发生时计入当期损益；投资企业作为合并对价发行的权益性证券或债务性证券的交易费用，应当计入权益性证券或债务性证券的初始确认金额，这里不区分同一控制还是非同一控制。
总结：（1）直接相关费用：同一控制下的企业合并和非同一控制下的企业合并，与取得长期股权投资直接相关的费用计入管理费用；非企业合并取得的长期股权投资直接相关的费用，计入长期股权投资的入账价值。
（2）以发行权益性证券取得长期股权投资时，不管是企业合并还是非企业合并，与发行权益性证券直接有关的费用，应冲减权益性证券的溢价，即冲减资本公积，资本公积不足冲减时，调整留存收益。
（3）以发行债券取得长期股权投资时，不管是企业合并还是非企业合并，与发行债券直接有关的费用，应调整应付债券的初始确认金额，一般是冲减应付债券——利息调整科目。