结构化方法和原型化方法均属于信息系统的开发方法。一般认为，系统开发方法的产生和发展大致分为以下几个阶段：
20世纪60年代，没有固定的系统开发方法，每个程序员都按照自己的方式写代码，而且也没有什么说明性的文档，这时开发出的系统的程序很难被其他人读懂，后期的维护也很困难，这也是后来产生软件危机的重要原因之一。
20世纪70年代，出现了系统开发的结构化方法。它把系统开发过程分成若干个阶段，并且规定在每一阶段完成固定的工作，利用完整的开发文档记录整个开发工作，极大地改善了开发过程中的管理。
20世纪80年代初，友好的语言和自动化编程工具的出现，促成了原型化方法的产生的发展，这种方法对确定有效的用户需求十分有利。
20世纪80年代末期出现了另一种重要的面向对象的方法，它把数据和方法封装在一起作为一个对象，通过众多对象间的相互联系构建出管理信息系统，这种方法特别适用于图形、多媒体和复杂系统的开发。
结构化方法是使用最广的一种方法，它将系统开发划分为若干个阶段（比如总体规划、系统分析、系统设计、系统实施、运行维护等），并严格按照自顶向下、逐步求精的原则进行系统分析，只有当上一个阶段的工作完成，并将工作成果撰写成文档报告后，才能开展下一阶段的工作。很难说结构化方法和原型化方法到底哪个更好，实际上它们各有优缺点，一般说来，结构化方法属于一种严格的、需求预定义方法，只有在分析清楚用户需求后，才能着手系统实施工作（简单地讲，就是编程工作），而原型化方法则属于一种需求动态定义的方法，在初步了解了用户需求的基础，就着手编程工作，制作系统的原型。
两者相比，结构化方法的主要优点按部就班，不容易出现大的错误，但缺点是过于死板，开发周期较长。原型化方法的主要优点是便于快速分析出用户的真实需求，但缺点是必须以自动化编程工具为基础，同时规范化程度不高，不利于大系统的开发。当然结构化方法和原型化方法不是两种对比的方法，一般认为原型化方法只是结构化方法的一种变形或补充，它常常与结构化方法结合使用，主要用于分析用户的需求。