转座子可通过转座作用使外显子重新组合而赋予其新功能的基因出现，这是生物进化的原始材料，是遗传多样性获得的一个重要途径；
1）由转座子介导的外显子的重组，可导致新的功能基因的出现；
2）直接通过转座子的转座作用来实现外显子的重组；
3）由逆转座子介导的外显子重组；
通过复制性转座使得基因产生重复从而有利于基因的进化（原有基因仍有作用，而新产生的基因可发生新的突变，从而获得新的性状，在进化过程中，产生不同的基因座）。