1，1861年，清政府为办理洋务，成立了“总理各事务衙门”，内设有“司务厅”和“清档房”，分别负责文书和档案工作。1901年，总理各国事务衙门改为外务部，内设日常办公的秘书机构有6个。1911年，清廷成立责任内阁。责任内阁的秘书工作机构有：承宣厅，负责宣布诏令，办理奏折，文稿，保管图书档案等。在中央各部门，也设立了秘书机构。这些新的衙门及其秘书机构成立不久就随着清王朝的覆灭而瓦解，但它标志着中国官制及其秘书工作已随时代变化而出现了变化。
2，鸦片战争后，晚清的公文问题也有了新的变化，出现了不少对外公文种类。在文件档案的内容上，也有所变化，突破了传统皇家官僚文件档案的范围，出现了技术文件档案和教育文件档案。洋务运动中还向外国派遣了留学生，在派遣及留学生管理中，也形成了一些关于留学生的文件档案。晚晴还出现了拍摄铁路、厂矿及重大事件的照片档案。
3在秘书人员的构成上，晚晴权臣及地方大员均大量使用幕僚。民间还出现了专门培养幕僚的私人开办的学校——“幕馆”。幕僚不属于政府任用的官吏，不是公职人员，其报酬不由国家支付，而由聘用的官员个人支付。主官与幕僚之间，双向选择，合则留不合则去。