个案研究资料的表面存在形式没有一定的规则，内容和结构形式都比较凌乱。由于实地研究所获得的现场资料通常较为凌乱和无序，因此分析个案研究资料首先遇到的问题是要对它们进行整理。可分为整理笔记、编码、提炼概念和撰写分析性备忘录等几种形式。
笔记整理，通常是对现场笔记进行分类、建档和编码。
编码是从原始材料中组织出概念类别和研究主体类型，然后用这些概念和主体来分析资料。
提炼概念是指研究者根据收集到的资料来形成新的概念的过程。
分析性备忘录是实地笔记的一个特殊类型，它是实地研究者对自己在整理和编码资料、提炼概念过程中的想法和观点的记录或讨论。