核被膜上有许多孔，称为核孔（nuclear  pore），是细胞核膜上沟通核质与胞质的开口，由内外两层膜的局部融合所形成，核孔的直径为80～120nm。核孔是以一组蛋白质颗粒以特定的方式排布形成的结构，它可以从核膜上分离出来，被称为核孔复合物。
NPC是一轮形结构，外经120nm，并呈现8面对称。轮毂是一个圆柱形的活塞（plug），称之为中央运输蛋白（central   transporter）。从中央运输蛋白向外伸出8个轮辐（spoke）并与核孔复合物的细胞核面的核质环（nucleoplamicring）和细胞质面的胞质环（cytoplasmic   ring）相连。在胞质环的表面常有8个细胞质颗粒位于其上，而核质环上有细纤丝伸向核质，形成笼形结构，称之为篮。在某些生物中，NPC篮常同一种交织的纤维层相连，称之为核被网格（nuclear   envelope    lattice）。