一、物理医学派物理医学派，也叫自然科学派。在桑克托留斯、哈维等学者将物理学只是应用到医学上，并取得成功后，这一学派主张用物理学原理解释一切生命现象和病理现象，代表人物是法国数学家、物理学家笛卡尔。这种只用机械观点来解释生命现象的学说虽有一定的科学性，但也存在着片面性。
二、化学医学派化学医学派的观点与物理学派相反，这一学派把生命现象完全解释为化学变化。化学派的创始人是海尔蒙特。他认为人的生理机能纯粹是化学现象，由“特殊精力”所推动，由感觉灵魂所掌握，“特殊精力”产生在人的胃内。这一学派的另一个代表人物是希尔韦厄斯。另一位代表人物是牛津大学的威利斯。化学派在解释人体生理现象方面的确作出过一定贡献，特别是在消化生理的研究中，用化学变化解释唾液、胃液、胰液的功能是很正确的。化学派在17世纪的医学中占有一定地位。
三、活力论派活力论派以德国化学家兼医学家斯塔尔为代表，从他发表的《燃素论》一书中可知，他的观点看似深奥，实际上是拥护亚里士多德的理论，而反对笛卡尔“动物体是机器”的观点。活力学派认为生物体各种现象不可仅用物理、化学原理来解释，它是由一种完全不用于物理、化学的物质所支配，这种物质被称为“感觉性灵魂”，其特性与亚里士多德所说的灵魂很相似。灵魂有时也被称为活力，这一学派认为人体的内在化学反应是由活力所支配。