青椒病毒病由于病毒种类不同，危害症状也不同，主要有花叶、黄化、坏死和畸形4种症状。
（1）花叶型：分为轻型花叶和重型花叶两种。轻型花叶病叶出现明脉轻微褪绿。或有浓绿、淡绿相间的斑驳。病株无明显畸形或矮化，不造成落叶；重型花叶除表面有褪绿斑驳外，叶面凹凸不平，叶脉皱缩畸形，或形成线形叶，生长缓慢，果实变小，严重矮化。
（2）黄化型：病叶明显变黄，出现落叶现象。
（3）坏死型：病株部分组织变褐坏死，表现为条斑、顶枯、坏死斑驳及环斑等。
（4）畸形型：病株变形，叶片变成线状（即蕨叶），或植株矮小，分枝很多枝叶丛生。有时上述几种症状同时出现，引起落叶、落花、落果，严重影响青椒的产量。