急性坏死性小动脉、细动脉炎是基本病变；活动期病变以纤维素样坏死为主；慢性期血管壁纤维化明显，管腔狭窄，血管周围淋巴细胞浸润伴水肿及基质增加。
(1)皮肤：蝶形红斑的形成。皮损多见于面部，两颧及鼻梁有红色斑，并互相连接成边缘清楚的蝴蝶形红斑，镜下见表皮有萎缩、角化过度、毛囊角栓形成、基底细胞液化，真皮和表皮交界处水肿，基底膜、小动脉壁和真皮的胶原纤维可发生纤维素样坏死，血管周围有淋巴细胞浸润，类似病变也可发生于躯干和四肢。做免疫荧光检查时，可见真皮与表皮交界处有IgG、IgM及C3的沉积，形成颗粒状或团块状的荧光带，即“狼疮带”；
(2)肾：出现以狼疮性肾炎为主要表现的肾损害；
(3)心：非细菌性疣状赘性心内膜炎；
(4)关节：95%的病例受累。表现为滑膜充血水肿，单核细胞、淋巴细胞浸润等，紧接上皮处浅表部位的结缔组织内可出现灶性纤维素样坏死；
(5)脾：小动脉周围纤维化，形成洋葱皮样结构；
(6)肺纤维化和肝汇管区非特异性炎症。