1、朴素唯物主义认识论。首先，表现在他预见了战争胜负的认识，是建立在“五事”“七计”的客观的物质条件的基础上，彻底摆脱了“取于鬼神”、“验于度”“天命观”等唯心主义和‘先验论’。其次，他主张“先知”，强调知而后战。不仅仅提出了“知彼知己，百战不殆”的著名观点，而且较为准确的回答了求“知”的途径和方法问题。再次，孙子还认识到意识的能动作用。认为战争胜负不仅“可知”，而且“可为”，可以通过人为创造条件去争取，孙子关于“致人而不致于人”掌握主动性和论述，形成了东方兵学重视权谋的鲜明特征。
2、朴素的辩证法。首先，孙子主张全面看问题的观点，从事务的相联系中研究战争和指导战争。要求将帅必须“通过九变之利”全面地掌握战争中的各种情况，防止主观，片面性。其次，主张用发展变化的观点来研究战争，指出“兵形像水”战争没有固定的模式，只有随着情况的变化，才能“因敌而致胜”。再次，孙子认为战争的矛对立双方并不是静止的，固定不变的，而是相互依存的，彼此“相生”的，“乱生于治，怯生于勇，弱生于强”，通过一定的条件随时可以向它的对立面转化。第四，孙子运用一系列矛盾范畴，揭示了战争的某些本质和规律，诸如众寡，强弱，速久，虚实、奇正、攻守，治乱，勇怯，迂直，围阙等，体现了辩证市委的对立统一原则。