区别：（1）经营规模和会计核算不同。一般纳税人在规定的经营规模标准以上且会计核算健全；小规模纳税人在规定的经营规模以下且会计换算不健全。
（2）适用税率不同。一般纳税人适用税率主要有17%、13%、11%、6%和零税率；小规模纳税人主要有3%和5%。
（3）计算方法不同。一般纳税人采用一般计税办法计算税款，负担的进项税额可以扣除，即应纳增值税=销项税额-允许抵扣的进项税额；小规模纳税人一般采用简易计税办法，负担的进项税额不允许扣除，即应纳增值税=销项税额。
（4）发票的使用不同。一般纳税人可以领购并开具增值税专用发票，但小规模纳税人一般不能领购开具普通发票，但可以请其主管税务局管代开增值税专用发票。