协商解决医疗纠纷是解决医疗纠纷最重要的途径，在具体执行时应注意以下问题：
（1）不要使用"出于人道主义，给予患者经济帮助或者补偿"等用语，直接表述为"给予患者现金（或者赔偿）多少元"。因为前一说法可以理解为赠与行为，而不是对医疗纠纷的赔偿。给患者重新主张权利留下了空间。
（2）在协议中必须明确说明，患者明确知道医疗事故的处理有协商、卫生行政部门调解、诉讼三种处理方式，病人或者家属自愿选择协商方式，放弃申请鉴定和诉讼的途径，并且清楚地知道如果构成医疗事故可能获得的赔偿金额。
（3）协议中必须载明，患者及其家属在协议生效和履行后，不再以任何方式和任何理由向医院主张权利，自愿放弃诉讼权。
（4）协议必须由患者或者其委托的人，或者其继承人签字。有多个家属和继承人只推选代表的，应当在签字处写明代表全体家属。
（5）公安或者人民调解组织参加主持的，应当有主持人或者主持机关的签字盖章。
（6）协商处理解决之日起7日内，医院应当向卫生行政部门作出书面报告，并附协议书。