生态系统中的能量流动开始于绿色植物通过光合作用对太阳能的固定。绿色植物固定太阳能是生态系统的第一次能量固定，所以植物所固定的太阳能或所制造的有机物就称为初级生产量。
生态系统的能量流动是单向流动的，能量只是单程流经生态系统，是不可逆的。
能量在生态系统内流动的过程是能量不断递减的过程。当能量从一个营养级流向另一个营养级时，每一个营养级生物的新陈代谢活动（呼吸）都会消耗相当多的能量，这些能量最终都将以热量的形式消散到周围的空气中。
能量在生态系统中流动的过程中，把较低质的能量转化为另一种较少的高质量能量。
能量在生态系统中的流动是以食物链为主线。