会计方式的物流成本核算是要通过凭证、账户、报表的完整体系，对物流耗费予以连续、系统、全面地记录的计算方法。这种核算方法又可分三种具体形式：
（1）独立的物流成本核算体系它是把物流成本核算与财务会计核算体系截然分开，单独建立起物流成本的凭证、账户和报表体系。具体做法是，对于每项物流业务，均由车间成本核算员或者基层成本核算员根据原始凭证编制物流成本记账凭证一式两份，一份连同原始凭证转交财务科。据以登记财务会计账户，另一份留基层成本核算员据以登记物流成本账户。
（2）结合财务会计体系的物流成本计算它是把物流成本核算与企业财务会计和成本核算结合起来进行，即在产品成本计算的基础上增设一个"物流成本"科目，并按物流领域、物流功能分别设置二级、三级明细账，按费用形态设置专栏。当费用发生时，借记"物流成本"及有关明细账，月末按照会计制度规定，根据各项费用的性质再还原分配到有关的成本科目中去。
（3）物流成本二级账户（或辅助账户）核算形式这是指在不影响当前财务会计核算流程的前提下，通过在相应的成本费用账户下设置物流成本二级账户，进行独立的物流成本二级核算统计。以制造企业为例：在制造企业的各级含有物流成本的一级科目下设二级科目或增设费用项目，或者在编制记账凭证时设置"物流成本"辅助账户，在各二级账户下按物流功能设置三级账户，并按费用支付形态设置专栏。在按照财务会计制度的要求编制凭证、登记账簿，进行正常的财务会计成本核算的同时，根据记账凭证上的二级科目或辅助账户，登记有关的物流成本辅助账户及其明细账，进行账外的物流成本计算。将各种物流成本归入二级科目或辅助账户中，最后将各物流成本的二级科目分类汇总即可求得总得物流费用。