总体史思想
（1）从内容上扩大历史研究的对象，摈弃了狭隘的政治史、人物史，代之以包括地理、生态、经济、社会、政治、科技、文化在内的人类“全部”活动的历史；（2）从地域上延伸了历史研究的范围，摆脱了以“六角形”（法国）为中心的国别史，把视野扩展到整个地中海以至全世界，从国别史发展到世界史。（3）综合利用各种社会科学，沟通史学与社会科学。
地理历史结构主义：
强调地理因素对人类活动的极大限制作用，并把生态环境作为人类社会的一个系统引人历史研究领域，但他同时又反对地理环境决定论。
长时段理论
他认为，历史学所以不同于其他社会科学，主要体现在时间概念上。历史时间具有不同的节奏和多元性，布罗代尔区分为短时段、中时段和长时段。他还把长时段——地理时间——结构，中时段——社会时间——局势（情势），短时段——个体时间——事件对应起来。所谓短时段，也叫事件或政治时间，主要是历史上突发的事变，如革命、条约、地震等等，它转瞬即逝，对历史发展影响甚微。
所谓中时段，也叫局势或社会时间，是指在较短时期（十年、二十年、五十年以至一二百年）内起伏兴衰、形成周期和节奏的一些对历史起重要作用的现象，如人口的消长、物价的升降、生产的增减、工资的变化等。它对历史进程起着直接和重要的作用。
所谓长时段，也叫结构或自然时间，主要指长期不变或者变化极慢的，但在历史上起经常、深刻作用的一些因素，如地理、气候、生态环境、社会组织、思想传统等等。长时段现象构成历史的深层结构，构成整个历史发展的基础，对历史进程起着决定性和根本的作用。因此，历史学家只有借助长时段的观点，研究长时段的历史现象，才能从根本上把握历史的总体。
长时段理论是布罗代尔全部历史思想的出发点。