配送中心的总体设计是在物流系统设计的基础上进行的。由于配送中心具有收货验货、库存保管、拣选分拣、流通加工、信息处理以及采购组织货源等多种功能，配送中心的总体设计首先要确定总体的规模。进行总体设计时，要根据业务量、业务性质、内容、作业要求确定总体规模。
（1）预测物质量物流量预测包括历年业务经营的大量原始数据分析，及根据企业发展的规划和目标进行的预测。在确定配送中心的能力时，要考虑商品的库存周转率、最大库存水平。我们通常以备齐商品的品种作为前提，根据商品数量的ABC分析，做到A类商品备齐率为100％，B类商品为95％，C类商品为90％，由此来研究、确定配送中心的平均储存量和最大储存量。
（2）确定单位面积的作业量定额根据规范和经验，可确定单位面积的作业量定额，从而确定各项物流活动所需的作业场所面积。例如，储存型仓库比流通型仓库的保管效率高，即使使用叉车托盘作业，储存型仓库的走支道面积占仓库面积的30％以下，而流通型仓库往往要占到50％。同时，应避免一味追求储存率高，而造成理货场堵塞、作业混杂等现象，以至无法达到配送中心要求周转快、出货迅速的目标。
（3）确定配送中心的占地面积一般来说，辅助生产建筑的面积为配送中心建筑面积SDC的5％～8％；另外还得考虑办公、生活用户建筑面积为配送中心的5％左右。于是，配送中心总的建筑面积便可大体确定。再根据城市规划部门对建筑覆盖率和建筑容积率的规定，可基本上估算出配送中心的占地面积。
（4）制定配送中心建设的细目计划细目计划是根据基本计划确定的方案。它是编制具体实施条目和有关设备型式和细部的计划。
细目计划应研究的内容主要包括以下各点：
（1）装卸、搬运用的容器尺寸和形状；
（2）装卸、搬运用的容器和设备规模；
（3）保管用的容器和设备规格；
（4）确定保管、搬运、装卸用的辅助机器；
（5）特殊车辆用的辅助机器；
（6）装卸车辆用的辅助机器；
（7）配送中心内部作业场所的详细配置；
（8）机器、设备的配置方案；
（9）各类商品的保管场所；
（10）作业能力的配置和使用方法；
（11）事务处理、情报处理的附属设备的规格和数量。