当吸附器充分地吸附了杂质以后，杂质界面最前沿为氮气、一氧化碳，其次是甲烷，再次是二氧化碳，最底层是微量的水。
杂质在吸附剂中的分布规律与吸附剂对各杂质组分的吸附能力以及吸附剂的分布状况有关。在吸附器中，活性炭作为主要的吸附剂装填在下部，分子筛作为辅助吸附剂装填在上部。进料气由吸附器底部进入床层，首先接触活性炭，而活性炭对杂质的吸附能力的大小次序为：H₂＜＜N₂＜CO＜CH₄＜CO₂＜H₂O，所以吸附过程H₂O、CO₂、CH₄、CO、N₂被依次吸附下来。剩余的杂质N₂又被上部分子筛吸附，从而获得高纯度的氢气。