（1）存在不当之处。处理意见：①企业发生的符合条件的广告费和业务宣传费支出，除国务院财政、税务主管部门另有规定外，不超过当年销售（营业）收入15%的部分，准予扣除；超过部分，准予结转以后纳税年度扣除。甲公司业务宣传费扣除限额=3000×15%=450（万元），实际发生额为500万元，应按照限额450万元在税前扣除。②向建材城支付的赞助费属于赞助支出（与生产经营活动无关），不得在税前扣除。（2）存在不当之处。处理意见：企业发生的与生产经营有关的业务招待费支出，按照发生额的60%扣除，但最高不得超过当年销售（营业）收入的0.5%。（3）存在不当之处。处理意见：根据企业所得税相关规定，下列资产损失，应以清单申报的方式向税务机关申报扣除：①企业在正常经营管理活动中，按照公允价格销售、转让、变卖非货币资产的损失；②企业各项存货发生的正常损耗；③企业固定资产达到或超过使用年限而正常报废清理的损失；④企业生产性生物资产达到或超过使用年限而正常死亡发生的资产损失；⑤企业按照市场公平交易原则，通过各种交易场所、市场等买卖债券、股票、期货、基金以及金融衍生产品等发生的损失。甲企业固定资产非正常报废清理的损失应进行专项申报。（4）存在不当之处。处理意见：根据企业所得税相关规定，研究开发费未形成无形资产计入当期损益的，在按照规定据实扣除的基础上，按照研究开发费用的50%加计扣除；形成无形资产的，按照无形资产成本的150%摊销。（5）存在不当之处。处理意见：母公司以管理费形式向子公司提取费用，子公司因此支付给母公司的管理费，不得在税前扣除。（6）存在不当之处。处理意见：甲公司直接向山区的捐赠不属于公益性捐赠，超过年度利润总额12%的部分不允许税前扣除。（7）存在不当之处。处理意见：企业根据国家有关政策规定，为在本企业任职或者受雇的全体员工支付的补充养老保险费、补充医疗保险费，分别在不超过职工工资总额5%标准内的部分，在计算应纳税所得额时准予扣除；超过的部分，不予扣除。企业全额扣除的做法不符合上述规定，超过职工工资总额5%的部分不能在企业所得税前扣除。（8）存在不当之处。处理意见：未经核定的准备金支出不得在税前扣除。（9）存在不当之处。处理意见：安置残疾人员所支付的工资费用可以加计扣除，在按照支付给残疾职工工资据实扣除的基础上，按照支付给残疾职工工资的100%加计扣除，应扣除的金额为40万元。（10）存在不当之处。处理意见：中国境内企业和非居民企业签订的特许权使用费的合同或协议，如果未按照合同协议约定的日期支付相关款项，但是已经计入企业当期成本、费用，并且已在企业所得税年度纳税申报时作税前扣除的，应在企业所得税年度纳税申报时按照企业所得税法的有关规定代扣代缴境外企业的企业所得税。