1）在离子交换过程中，弱酸树脂只能与水中的碳酸盐硬度交换而生成碳酸，与其他阳离子不起作用。因此利用弱酸树脂时在去除水中碳酸盐硬度的同时也降低了水的碱度；
2）弱酸树脂即使在去除水中的碳酸盐硬度时，也有一定的泄漏率，而且这泄漏率会随着弱酸树脂的失效程度加深而不断增大；
3）由于弱酸树脂不能去除除碳酸盐硬度外的非碳酸盐硬度和钠离子等其他阳离子，所以在除盐过程中必需与强酸树脂联合应用；
4）弱酸树脂的工交容量高，价格也高，况且它的离子交换有严重的局限性，因此它对于大多数碳酸盐硬度较低的地表水的处理中有一定的限制。