DNA片段属于带电质点。在一定电场作用下，一定大小的DNA片段以不同的速度通过不同浓度的琼脂糖凝胶，DNA的迁移率(μ)对数和凝胶浓度之间的线性关系遵循下列关系，即：lgμ0=lgμ-KrC，μ0的为自由电泳迁移率，Kr为滞留系数，是与凝胶性质和迁移分子大小及形状有关的常数。因此利用不同浓度的凝胶可以分辨不同大小的DNA片段。溴化乙锭(BB)是一种荧光染料，这种物质含有插入DNA积叠碱基之间的平面结构。这一结构的位置固定，与碱基很接近，使染料与DNA紧密结合。在紫外线照射下，可产生较强的荧光，故可以使用该方法进行DNA的鉴别。