１、40名职工应分案处理，5名职工与35名职工分别推举代表，代表人数由仲裁委员会确定。关键是"共同理由"，共同理由是指职工一方3人以上发生劳动争议后，基于同一事实经过而且申请仲裁的理由相同。5名职工有共同理由，都是要求去分厂，企业也都是以"不服从调动"为由解除合同；另35名职工也有共同理由，企业都是因设备变化而难以安排。两批人之间尽管申诉的请求相同，但没有共同理由，企业对前一批人是用劳动法第二十五条处理，对后一批人是用劳动法二十六条处理。
２、5名职工应按劳动争议的一般程序处理；35名职工属于集体劳动争议，适用"案件特别审理"程序。３、该企业的处理不正确。因市政动迁，劳动合同订立时所发生的客观情况发生了重大变化，但40名职工均在合同期内，5名职工要求到分厂工作实际上是提出了变更合同的请求，企业不应以不服从调动为由解除合同；另35名职工，是企业难以安置，企业应提出变更合同的具体方案。
４、5名职工如坚持到分厂工作，而分厂又确实无法安排，双方应依据《中华人民共和国劳动法》第二十六条，在提前一个月通知并给予经济补偿的情况下解除劳动合同。对35名职工企业应提出变更合同的具体方案，对职工妥善安置。