目前普遍的观点，即合同中的仲裁条款，独立于其所属的合同。亦即，并不影响该仲裁协议的效力。这就是所谓的“仲裁条款自治理论”。这一理论的根据是，凡以仲裁条款的形式出现的仲裁协议，应被视为是由与当事人之间有关合同的其他部分相分离的单独协议，即一个包含仲裁条款的合同，应被视为是由两个相对独立的合同构成的。尽管可以认为，规定当事人双方在商业利益方面的权利义务关系的合同为主合同，而另一个以仲裁条款形式出现的仲裁协议为从合同，但是这两者不能适用“主合同无效，从合同亦随之无效”的一般法理，…… 我国的有关立法也承认仲裁条款自治理论。
《中华人民共和国涉外经济合同法》第 35条规定：“合同约定的解决争议的条款，不因合同的解除或者终止而失去效力。”又如《中国国际经济贸易仲裁委员会仲裁规则》规定：“合同中的仲裁条款应视为与合同其他条款分离地、独立地存在的一个部分；合同的变更、解除、终止、失效或无效以及存在与否，均不影响仲裁条款或仲裁协议的效力。”1995年9月1日起施行的《仲裁法》第19条第1款同样从法律上肯定：“仲裁协议独立存在，合同的变更、解除、终止、失效或无效，不影响仲裁协议的效力。”