为了克服常规方法存在的缺点，长期以来人们在对常规“成本-收益分析法”进行改进和扩展基础上，提出了旨在提高公共投资项目评估质量的“公共项目综合评估法”。对公共投资项目进行综合评估，是对其广义成本效益的核算，即对工程项目总体绩效的全面评估，而非局限于其实际成本及收益。多种综合评估方法已经广泛应用于公共项目评估的领域，为财政资金的投资效果评价提供了重要依据。定量分析方法和定性分析方法在公共投资项目评估领域都有应用，两者互为补充。
定量类综合评估方法为项目评估提供了实用、直观的评估过程，通过量化使评估结果更加清晰、确定。现实中，主要应用的定量类综合评估方法有模糊综合评估法、层次分析法、主成分分析法、人工神经网络评估法、DEA评估法、灰色关联度评估法等。基于模糊综合评估法、层次分析法、主成分分析法等基本综合评估方法，人工神经网络评估法、DEA评估法、灰色关联度评估法等更为复杂的评估方法逐渐更多地应用到实践中。定性类综合评估方法有评分法和优序法等。