二级生物安全实验室的标准操作有以下操作：
（1）工作一般在桌面上进行|采用微生物的常规操作和特殊操作。
（2）工作区内禁止吃、喝、抽烟、用手接触隐形眼镜和使用化妆品。食物贮藏在专门设计的工作区外的柜内或冰箱内。
（3）使用移液管吸取液体|禁止用嘴吸取。
（4）操作传染性材料后要洗手|离开实验室前脱掉手套并洗手。
（5）制定对利器的安全操作对策。
（6）所有操作均须小心|以减少实验材料外溢、飞溅、产生气溶胶。
（7）每天完成实验后对工作台面进行消毒。实验材料溅出时，要用有效的消毒剂消毒。
（8）所有培养物和废弃物在处理前都要用高压蒸汽灭菌器消毒。消毒后的物品要放入牢固不漏的容器内|按照国家法规进行包装，密闭传出处理。
（9）昆虫和啮齿类动物的控制应参照其它有关规定进行。
（10）妥善保管菌、毒种，使用要经负责人批准并登记使用量