公司企业属于法人企业，须就其应纳税所得额缴纳企业所得税，缴税后的利润才可以在投资者之间分配。投资者所分得的税后利润还需要缴纳个人所得税。其中：
应纳税所得额=收入总额－不征税收入－免税收入－各项扣除－以前年度亏损
企业所得税基本税率为25%，低税率为20%，高新技术企业税率为15%。投资者所分得的利润缴纳个人所得税的税率为20%。
个人独资企业不是法人单位，须就其取得的经营成果（应纳税所得额）按照个体工商户所得项目缴纳个人所得税，不用缴纳企业所得税。其中：
应纳税所得额是指每一纳税年度的收入总额，减除成本、费用及损失后的余额，税率为五级累进税率。
一般而言，对于规模庞大、管理水平要求较高的大企业，一般宜采用公司企业形式，这不仅因为规模大的企业筹资难度大，而且这类企业管理相对要求高，经营风险大，如果采用个人独资形式，很难正常健康地运转起来。公司企业的信誉好，在融资上存在优势，税收环境相对宽松。对于规模不大的企业采用个人独资或者合伙企业形式比较合适。这类企业由于规模小，管理难度不大，而且在税收上也会获得优惠，从而获得较高的利润。