（一）、电子商务物流从本质上属于现代物流，是现代物流的重要组成部分。现代物流是物流发展的一个阶段，其物流水平在发展过程中随着时间的推移而提高。在现代物流阶段，由于物流活动具有的自身规律，与不同经济发展水平相伴随的现代时期的物流，都可以归结到现代物流中。
（二）、电子商务物流与现代物流的差别。首先，现代物流可以指物流发展的一个阶段，而电子商务物流只是现代物流的一种类型。其次，从信息化程度看，电子商务物流更加注重物流活动的信息化、网络化。第三，电子商务物流更加注重第三方物流，强调物流活动的社会化，或者说物流活动与物流管理在社会经济主体中的共生性。第四，电子商务物流更加强调增殖性物流服务。
（三）、由于电子商务在世界范围内都只是处于起步阶段，电子商务中的物流并没有形成区别于现代物流的特有运作方式。在现代物流发达的国家，在发展电子商务时实行的是电子商务与现代物流的直接对接；而在发展中国家，由于现代物流的发展水平还很低，要发展电子商务不得不首先发展现代物流，以致于把现代物流与电子商务物流等同。