1.色球藻属（蓝球藻属）细胞球形或半球形，有单细胞或分裂成3—4个或更多的细胞群体。
2.蓝纤维藻属（拟指杆藻属）：单细胞、纤维形、S形；有时几个细胞聚集成群体，包埋在一个公共的胶被内。
3.微囊藻属（微胞藻）：藻体呈球形、长椭圆形或不规则形的多细胞群体，群体外胶被均匀无色。单个细胞球形或椭圆形，大量繁殖（pH8-9.5），形成“水华”。俗称“湖靛”。
4.平裂藻属（片藻）：一层两两相对组成的平板状群体，群体方形或长方形；细胞球形或椭圆形。
5.束丝藻属：藻丝单一或侧面相连成束状群体，丝体不分枝，直或弯曲。藻丝中部细胞短柱形，具假空泡，末端细胞尖细，延长成无色细胞，胶鞘不清。
6.鱼腥藻属Anabaena：细胞球形或桶形，异形胞间生，厚壁孢子较大，呈长圆形，一或几个串连在一起。
7.拟鱼腥藻属：特征与鱼腥藻相似，仅异形胞端生。
8.念珠藻属：类似鱼腥藻的群体，交织在充满浓厚胶质的公共衣鞘中。
9.颤藻属：不分枝丝状体，单列或由许多藻丝结成团块，漂浮于水面，呈深蓝绿色。每个细胞圆短柱形、桶形。丝体顶端直或弯曲，能颤动，顶端细胞呈帽状。
10.螺旋藻：单细胞圆柱状或多细胞组成丝体，无衣鞘。呈疏松或紧密的有规则的螺旋体，细胞间的横隔壁常不明显。
11.席藻属：席藻的单细胞圆柱形，横壁收缢或不收缢，末端渐尖；席藻为不分枝的直或弯曲丝状体；细胞壁具薄的无色的胶。
12.鞘丝藻属（林氏藻属丝体不分枝，以基部着生，藻丝直或螺旋缠绕；胶鞘坚厚、伸出藻丝外，无色、黄色、红色，分层或不分层；细胞内含物均匀，具假空泡或颗粒，群体集成团块。