科学研究是始于问题的。
传统观点认为，科学研究始于观察实验。不仅在古代，在现代也有人依据马克思哲学关于认识源于实践的基本命题，进一步推出科研始于观察。这种观点长期以来极为流行，它虽然对科学史上的许多研究活动作过一定的说明，但始终未能对科学研究的起点作出合理的解释。
科学研究无疑与观察事实有关，但是如果观察到某一事实而不由此引出问题，那么即使是观察到前人从未观察到的新事实也不会因此而进入新的研究。可见科学观察本身不足以成为科学研究活动的起点。再从理论上看，研究对象越是远离经验世界，如各门学科中的理论研究部分，其研究越是不可能直接从观察实验入手。如果否认这一点，无异于从根本上取消理论研究本身。对此，当代有见地的科学家和哲学家都认为，科学研究是从问题开始的。只有提出问题，才可以说是真正地进入了研究。问题的提出对于科学研究有着极为重要的意义。爱因斯坦曾经说过：“提出一个问题比解决一个问题更为重要，因为解决一个问题也许仅是一个数学上或实验上的技能而已；而提出新问题、新理论，从新的角度去看旧的问题，却需要创造性的想象力，而且标志着科学的真正进步。”
差异：
“科学研究始于问题”和“科学研究始于观察”这两种观点有着原则上的区别，前者把科学研究看作是能动的、创造性活动，后者把科学研究看成是自发的、消极的活动。
科学研究始于问题是从具体的研究过程而言的，具有方法论的指导意义。它告诉我们从何着手研究，它与人类认识源于实践并不矛盾。从认识发生学的角度和科学认识的总秩序来说，问题最终来自观察实验，科学始于观察实验，认识源于感性经验，这是认识论的唯物论路线。可见，科学始于问题和认识源于实践这两个命题是从不同角度提出来的，它们既相互区别又相互联系。我们既不能由认识源于实践简单地断言科研始于观察，也不能由科研始于问题错误地推出科学始于问题。