为了加速培养少数民族人才，促进西部大开发战略的实施，中央决定进一步加大内地教育支援新疆的工作力度，借鉴举办内地西藏班（校）的经验，于2000年秋季在北京、上海、天津等12个经济较发达的城市开办内地新疆高中班。2000年首期招收新疆少数民族应届初中毕业生1000人，每班40人，共办25个教学班。
目前，内地新疆高中班学生与当地学生同校分班，待条件成熟后再过渡到与当地学生混合编班。高中毕业后，按有关规定，凡符合条件的，可升人内地的高等学校学习。