一、出现了儒、释、道三教融合的局面。如白玉蟾，著有《玉降集》、《上清集》、《武夷集》。全真道北宗更是主张三教合一，认为三教同源，以《道德经》、《孝经》、《般若波罗密多经》。
二、在三教融合的基础上，道教修持方法发生了根本转变。内丹学逐渐成了道教主要的修持方法。同时，以为“长生”就是延长生命，提供修道的时间，只有炼成永存之“元神”，与道融为一体，才是修炼的目的。这个修炼观念的变化是道教教义的根本性转变，这使金元全真道的面目同以前宣传肉体不死信仰的道教有了本质不同。