裸子植物在系统发育过程中，主要演化趋势是：植物体茎干由不分枝到多分枝，孢子叶由散生到聚生成各式孢子叶球，大孢子叶逐渐特化；雄配子体由吸器发展为花粉管；雄配子由游动的、多纤毛精子，发展到无纤，毛的精核；颈卵器由退化发展到没有等等。在这各个方面的演化方向上，买麻藤纲均处于进化地位，尤其是买麻藤纲植物茎内次生木质部具有导管，孢子叶球有类似花被的盖被，胚珠包裹于盖被内，许多种类有多核胚囊而无颈卵器，这些特征是裸子植物中最进化的性状。所以买麻藤纲是裸子植物中最进化的类群。