灵渠工程主体包括铧堤、南北渠、秦堤、陡门等，依据梯级船闸原理设计，故A项正确。小孔成像所运用的原理是光沿直线传播原理，故B项错误。“引水灌溉，分洪减灾”是四川都江堰建造依据的科学原理。故C项错误。坐标系统原理是指中国古人认为地是平的，大小有限，这样地表面必然有个中心，过该中心的那条子午线就是唯一的南北方向。而实际上司南的原理是指南针定位原理，即地球是个大磁体，其地磁南极在地理北极附近，地磁北极在地理南极附近。指南针的“针”实际上就是一块针形磁铁，在地球的磁场中受磁场力的作用，会一端指南一端指北。故D项错误。