1．招标代理机构通常承担的招标代理事宜有：
　　（1）策划和制订招标方案或协助办理相关核准手续，包括编制发售资格预审公告和资格预审文件、协助招标人组织资格评审，编制发售招标文件；
　　（2）组织潜在投标人踏勘现场和答疑、发澄清文件、组织开标；
　　（3）配合招标人组建评标委员会、协助评标委员会完成评标与评标报告、协助评标委员会推荐中标候选人并办理中标候选人公示；
　　（4）协助招标人定标、发出中标通知书并办理中标结果公告、协助招标人签订中标合同；
　　（5）协助招标人向招标投标监督部门办理有关招标投标情况报告；
　　（6）处理投标人和其他利害关系人提出的异议，配合监督部门调查违法行为；
　　（7）招标人委托的其他咨询服务工作。
　　2．（1）第①项质疑成立。
　　理由：《招标投标法实施条例》第26条规定，招标人在招标文件中要求投标人提交投标保证金的，投标保证金不得超过招标项目估算价的2％。则本案例中，投标人收取的投标保证金不得超过200万元。
　　（2）第②项质疑不成立。
　　理由：根据《工程建设项目施工招标投标办法》第15条规定，对招标文件或者资格预审文件的收费应当合理，不得以营利为目的。《国家计委关于印发（招标代理服务收费暂行办法）的通知》（计价格[2002]1980号）第9条规定，出售招标文件可以收取编制成本费。因此，在本案例中，招标人向每位投标人收取印制成本费是符合规定的。
　　3．Q公司在招标过程中的不当之处及理由具体如下：
　　（1）不当之处：投标人的投标文件未按招标文件的要求密封，成为符合规定的投标文件。
　　理由：根据《工程建设项目施工招标投标办法》第50条的规定，未按招标文件要求密封的，招标人不予受理。本案中，Q招标公司将其重新装入D公司的招标文件中并使其成为合法的投标人，这种行为显然是不符合法律规定的。
　　（2）不当之处：D公司没有派人出席开标会议，而被招标方当场宣布其为废标。
　　理由：《招标投标法》第35条规定，开标由招标人主持，邀请所有投标人参加。由此可以认为，招标人邀请所有投标人参加开标是法定的义务，参加开标会议是投标人的权利。投标人或其授权代表有权出席并监督开标会议，也可以自主决定不参加开标会议，不影响投标的有效性。因此，Q公司宣布D公司的投标为废标的行为显然不合法。
　　（3）不当之处：E公司的投标文件没有响应招标文件的实质性要求和条件，修改了后允许其继续参加评标。
　　理由：根据《工程建设项目施工招标投标办法》第52条的规定，投标文件不响应招标文件的实质性要求和条件的，招标人应当拒绝，并不允许投标人通过修正或撤销其不符合要求的差异或保留，使之成为具有响应性的投标。本案例中，Q公司帮助E公司修改不符合要求的差异，并允许其成为合格投标人的行为显然是不符合法律规定的。
　　4．（1）E公司的分包行为是合法的。
　　（2）理由：《招标投标法》第48条第2款规定，中标人按照合同约定或者经招标人同意，可以将中标项目的部分非主体、非关键性工作分包给他人完成。接受分包的人应当具备相应的资格条件，并不得再次分包。因此，本案中，E公司在中标后，将工程的装饰工程和水电暖工程分别分包给甲公司和乙公司，这种行为是符合法律规定的。
　　5．根据《招标投标法》第48条第3款的规定，中标人应当就分包项目向招标人负责，接受分包的人就分包项目承担连带责任。本案中，中标人E公司应当就该水电暖工程给大学带来的损失负责。同时，接受分包的乙公司应当就分包的水电暖项目与E公司一起承担连带责任。