重整原料和其它石油馏分一祥，主要是由碳和氢两种元素组成的烃类化合物，但是也有一些含硫、氧、氮等元素组成的化合物和含有砷、铜、铅等金属元素组成的金属有机化合物。这两种化合物统称为非烃化合物。非烃化合物在重整原料中的含量虽然不多，但是对重整反应过程的影响却很大。
（1）杂原子化合物
重整原料中的杂原子化合物主要是含硫、氮化合物。
①含硫化合物
通常重整原料中含硫化合物主要有：硫醇（RSH）、硫醚（RSR}，二硫化物（RSSR），噻吩等。硫在各种重整原料中的数量从百万分之几到万分之几不等。它对重整反应过程影响比较特殊。首先，它是重整催化剂的毒物，在反应过程中，各种硫化物将转化成H2S，在重整系
－统中H2S浓度增加到一定程度（例如>0.5×106），就使现代双金属重整催化剂的活性和选择
性受到损害，由于硫中毒造成重整装置停工的事故并不罕见，但是，利用硫对重整催化剂活性的减活作用，可限制某些催化剂（如Pt-Re催化剂）开工时超温现象，因此，铂铼重整装置工时通常需要向催化剂床层注硫，这就是所谓的预硫化过程。
此外，硫对系统的设备还有腐蚀作用。
②含氮化合物
重整原料中的含氮化物主要包括吡咯，吡啶等。
重整原料中的氮含量，通常比硫更少。在重整反应条件下，氮化物将转化成NH3和烃，NH3是碱性化合物，将降低催化剂的酸性功能。
（2）金属有机化合物
①含砷化合物
重整原料中代表性的含砷有机化合物有：二乙基砷化氢（C2H5）2AsH，沸点为161℃；三乙基砷（C2H5）3As。沸点为140℃；三甲基砷化氢（CH3）3AsH，沸点为52℃。
总的来说，对重整原料油中的砷化物尚不太清楚，但是砷对重整催化剂的严重危害，在国内外重整技术开发过程中有过深刻教训。已经证实砷（As）能与铂（Pt）生成PtAs化合物，使催化剂丧失活性，而且不能再生复活，属永久性中毒。
②含铜、含铅化合物
含铜、含铅化合物与砷化合物一样，也是重整催化剂的永久性毒物（即不能再生复活）。