微生物的生长繁殖需要不同的营养条件，因此培养基的种类很多，利用细菌分解糖类和蛋白质的能力及其代谢产物的不同，在培养基中加入特定的作用底物和指示剂来观察细菌生长，这种培养基称为鉴别培养基，如糖发酵管、KIA、MIU培养基等。在培养基中加入抑制剂，去抑制标本中的杂菌生长，有助于对所选择的细菌种类的生长的培养基是选择培养基。如SS琼脂，其中的胆盐能抑制革兰阳性菌，枸橼酸钠和煌绿能抑制大肠埃希菌，因而使致病的沙门菌、志贺菌容易分离到。