机体的免疫功能或反应的异常是一起各种肾脏疾病的重要原因，在循环中特异性的抗体-抗原结合形成免疫复合物。沉积在肾小球基底膜并激活补体而造成肾组织损害。基底膜细胞间缝隙的孔径大小对IgG、IgA、IgM滤过起着主要的屏障作用，感染、肾中毒、血管病变和免疫损伤等均可导致基底膜孔径变大，单纯性膜孔径轻度增大时，尿液中以IgG滤出增多为主，形成部分选择性肾小球性蛋白尿；当滤过膜损伤加重时，尿液中除IgG排出率增加外，分子量较大的IgM也开始滤出增多，形成非选择性肾小球性蛋白尿。此外，在IgA肾病患者虽无血清免疫球蛋白浓度的特异性改变，但约40%-50%的IgA肾病患者血清IgA明显高于正常。尿液中游离轻链的检测对诊断轻链病是不可缺少的步骤，并对多发性骨髓瘤等疾病的分型鉴定及预后判断均有重要意义。