(1)目前尚无一种对所有种类的循环免疫复合物均能有效检测的方法。
(2)不同方法检测循环免疫复合物原理各异，检测结果有时不相关，如用同一种方法其结果为阳性，而另一种方法检测结果可能是阴性，产生假阳性和假阴性原因也不一样，因此在检测时，最好用几种方法同时进行，以提高阳性检出率。
(3)大多数方法在检测中都易受到非特异性原因造成的Ig聚合物或非免疫因素抵抗补体活性等各种因素的干扰，而且这种干扰因素很难控制，重复性差，正常参考范围大，试验结果的可靠性差。
(4)目前尚无理想的标准化措施，大多以HAHG为标准品绘制标准曲线，以实现免疫复合物定量，但其代表性有限，会出现实验偏差。