（1）代谢类型多样、遗传资源丰富，具有潜在用途和价值；（2）微生物分布广、种类多、繁殖快、代谢强、易变异、利生产，是进行大规模工厂化生产，获取高收率产物的理想资源；（3）对微生物可利用资源的探索尚存在很大空间，具有开发、挖掘新资源的巨大潜力。可利用的微生物资源有：（1）微生物菌体，如活性酵母、单细胞蛋白、微生物杀虫剂、细菌肥料、食用菌等。（2）微生物的代谢产物：氨基酸、有机酸、醇、酮、多糖、核酸、维生素、酶制剂等。（3）微生物的代谢活动：甾体转化、湿法冶金、石油勘探等；（4）微生物基因：以苏云金芽孢杆菌毒蛋白基因构建抗虫转基因植物，聚β-羟基丁酸基因转人拟南芥，产生可降解生物塑料PHB等。