假设检验与区间估计问题有许多相同之处，例如都是对总体未知参数作统计推断；在对参数已知与否所作的主要四种情形里，所选用的样本函数都是一样的；对双侧和单侧问题处理时，也有不少相近之处；并且，两者之间的统计推断也是相通的。
两者的不同之处：
（1）目的不同。区间估计的目的是对未知参数的一个取值变化范围（区间）的检验；假设检验则是对已经给出的有关未知参数的一个说法（结论）作检验，看这个说法是不是应该被推翻（拒绝）。
（2）态度不同。对未知参数给出估计的取值区间时，应该有相当大的把握，即应该有相当大（1-α）的概率，并称它为置信度；假设检验是要在已经给出的有关未知参数这个说法（假设）的条件下，确定对不能接受这个假设的容忍界限，从而制造一个小概率事件：当概率小于α时，便断然拒绝已经给出的说法（假设）。由于α常常很小，因此假设检验对“原假设”有相当大的偏袒，不是非常有把握不拒绝原假设。
（3）对未知参数给出的估计区间，是随机区间，选用的样本函数因为含有未知参数而不是统计量；假设检验在给出假设条件下，所有的样本函数不再含有未知参数而是统计量。当显著性水平α给定后，统计量的拒绝于是确定的区间，而不是随机区间。
（4）双侧区间估计的随机区间是数值线当中一个较大的区间，双侧假设检验中统计量的拒绝域在数值线的“两侧”。