A、侦查协作中抓获的犯罪嫌疑人，协办单位不得擅自变更强制措施。如有必要，立案单位可将犯罪嫌疑人的供述、笔录等涉案材料复制给协办单位备案。对经过审查不能依法逮捕、起诉的犯罪嫌疑人应当通报给协办单位，并说明情况，协办单位应配合主办单位共同做好善后工作
B、侦查协作中查扣的赃款赃物及其他用于犯罪的财产，协作双方应该共同清点。共同登记，并交由主办单位随案处理，协办单位不得重复扣押、冻结或擅自处理、截留
C、对联合办案查扣的赃款赃物、财产，需要分开处理的，从有利于调查取证。审查起诉和打击犯罪的角度出发，由协作双方协商解决。未能达成一致的，报请双方的上级协商解决。
D、偷渡等其他案件的罚没返还分配比例由协作双方协商，毒品案件中罚没返还分配比例参照公安部禁毒局相关规定执行