对糖酵解的影响，杀菌剂影响糖酵解有间接和直接的两种作用。
（一）间接作用：主要是一些传统的杀菌剂如铜、汞等重金属杀菌剂，这些药剂会破坏细胞膜的结构，使一些金属离子，主要是K^＋向细胞外渗透，而糖酵解过程中最重要的磷酸果糖激酶（PFK）中，是K^＋来活化的，丙酮酸激酶也需要K^＋作为辅助。因此这些酶的活性都会受到破坏而阻碍糖的酵解过程。
（二）直接作用：杀菌剂对酵解的直接作用，都是由于有关酶的活性受破坏。均是与-SH反应或结合的。这些药剂大都是传统的保护剂，有两类，一是含重金属的，如铜剂和汞剂；另一是有机化合物，如百菌清和克菌丹。