企业为本企业任职或者受雇的全体员工支付的补充养老保险费、补充医疗保险费，分别在不超过职工工资总额的5%标准以内的部分，准予扣除。补充养老保险扣除限额＝200×5%＝10（万元），实际发生了12万元，需要调增所得额2万元；补充医疗保险扣除限额＝200×5%＝10（万元），实际发生了8万元，不需要调整。职工福利费扣除的限额＝200×14%＝28（万元），实际发生了35万元，需要调增所得额7万元；软件企业支付给职工的培训费可以全额扣除，所以支付的4万元培训费可以全额扣除，职工教育经费扣除限额＝200×2.5%＝5（万元），实际发生了4万元，可以全额扣除；工会经费的扣除限额＝200×2%＝4（万元），实际发生3.5万元，可以全额扣除。综上分析，上述费用应调增所得额为9万元，可以填写在所得税纳税申报表主表第15行。