有机物质在体内生物氧化与体外化学氧化（燃烧）的反应实质相同：均有脱氢、失去电子、与氧结合等过程，都生成CO2和H2O，而且释放总能量相等，但二者也有很大区别：
①生物氧化进行条件温和（常温、常压、近中性PH和有水的环境）体外燃烧条件：高温、高压及干燥条件下
②生物氧化的进行是酶、辅酶、电子传递系统参与下逐步的还原过程，并伴有能量的逐步释放。体外燃烧则是剧烈的游离基反应，能量是突发式的释放出来。
③生物氧化释放的能量大多转变为ATP形式的活跃化学能体外燃烧所产生的能量则以光与热的形式释放到环境中